FlexS

Açıklama

FlexS, ligandlardan birinin diğerine göre uyumunu ve yönünü tahmin eder. FlexS'de referans ligandın katı olduğu varsayılır, bu nedenle bağlı duruma benzer bir konformasyonda verilmelidir. FlexS'deki süperpozisyon algoritması çok az manuel müdahale gerektirir. Tek adımları manuel olarak gerçekleştirerek bu bilgiyi FlexS ile hesaplamalara entegre edebilirsiniz. Bu nedenle FlexS, ligand tabanlı sanal taramanın yanı sıra ligand çiftleri üzerinde etkileşimli çalışma için tasarlanmıştır. FlexS'nin iki ana uygulaması ligand süper konumlandırma (örn. CoMFA/QSAR için) ve sanal taramadır. Bir proteininiz ve ona bağlanan küçük bir molekülünüz varsa (referans-ligand olarak adlandırılır) ancak proteinin yapısı yoksa, referans yapıyı aktif bölgenin negatif parmak izi olarak alabilirsiniz. FlexS, test ve referans yapısı arasındaki benzerliği hizalayarak belirler. Sanal taramada, bir referans ligandınız ve bir dizi bileşiğe sahipsiniz ve deneysel testler için bileşiklere öncelik vermekle ilgileniyorsunuz.