MultiGeneBlast
| Sürüm | 1.1.5 |
|---|---|
| Yayımcı | MultiGeneBlast |
| Yayın tarihi | 3 Nis 2013 |
| Ekleme Tarihi | 4 Nis 2013 |
| İşletim sistemi gereksinimleri | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Gereksinimler | None |
| Toplam indirme | 95 |
| Fiyat | Free |
Açıklama
MultiGeneBlast, NCBI GenBank protein girdilerinin FASTA başlıklarının yeniden biçimlendirilmesine dayanan ve kaynak nükleotidlerini ve koordinatlarını izleyebildiği açık kaynaklı bir araçtır. MultiGeneBlast, sentetik biyoloji projeleri için bu tür multigen parçalarının saptanmasına yardımcı olabilir. İşlevi kullanıcı tarafından istenene en yakın olan operonları tanımlamak için çıktısına dayalı olarak sentetik bir operon kütüphanesi oluşturulabilir. Bu araç, her bir gen üzerindeki tek BlastP çalışmalarının sonuçlarını birleştirerek ve herhangi bir GenBank girişinden genomik bölgeleri isabet sayısına, synteny korumasına ve kümülatif Blast bit puanına göre sıralayarak tüm homolog genomik bölgeleri tanımlama fırsatları sağlar. Herhangi bir kullanıcı tarafından belirtilen amino asit dizileri kombinasyonuna Blast isabetleri olan herhangi bir genomik bölgeyi bulmak için mimari aramalar yapılabilir.