| Sürüm | 1.0 |
|---|---|
| Yayımcı | Armin Topfer |
| Yayın tarihi | 6 May 2013 |
| Ekleme Tarihi | 6 May 2013 |
| İşletim sistemi gereksinimleri | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Gereksinimler | Java |
| Toplam indirme | 30 |
| Fiyat | Free |
Açıklama
QuasiRecomb, komut konsolunda çalışan ve viral Quasispecies oluşturmak için bir Markov modelini simüle eden hafif bir uygulamadır. Viral yarı türlerin oluşturulmasını ve yeni nesil dizileme verilerini analiz ederek parametrelerini çıkarmaya yönelik bir yöntemi açıklar. Model, rekombinasyon sürecini açıkça dikkate almanın avantajını gösteren simüle edilmiş veriler üzerinde doğrulanır ve deneysel HIV örneklerinden elde edilen okumalara uygulanarak test edilir. Model parametrelerinin maksimum a posteriori tahminlerini bulmak için EM algoritmasının bir uygulamasını ve yarı türlerdeki viral suşların dağılımını tahmin etmek için bir yöntem sunar.
